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在进行基因功能研究前,首先需要对基因有一个全方面的认识。在进行基因研究时,需要查询各种数据库获取基因蛋白的相关信息,以及各个公司查询相关的抗体产品信息等。其实,下面向您推荐一个神器的网站——Genecard(人类基因数据库),在这里你可以轻松全面查找基因的详细信息。
1进入网站主页,输入基因名称,比如P53。
2首先看到的是基因的别名,以及基因在不同数据库HGNC,Ensembl, OMIM,UniProtKB的ID编码。
3基因的简介,包括Entrez Gene,CIViC,GeneCards,UniProtKB/Swiss-Prot等多个数据库对基因的概括描述。
4基因组信息,包含调控元件、基因染色体定位。
5蛋白组信息,不仅包含了对蛋白的简介、剪切体的类型、蛋白的表达、转录后水平的修饰,还收录相关抗体信息、蛋白产品、芯片信息。
6蛋白功能域的介绍,以及蛋白功能域网站uniport对功能域相关注释。
7基因功能信息,包含了GO功能注释,基因表型以及相关敲除鼠模型,还可以查看基因cas9动物模型、基因敲减shRNA或者siRNA甚至稳定细胞系产品的相关信息。
8蛋白的细胞定位信息,当然也收录着不同亚型蛋白具体的定位信息。
9相关信号通路,包含了GeneTex pathways、 KEGG 、GeneGo 等多种通路信息。同时也收录了蛋白互作相关信息,比如STRING 互作网络图。
10网站还收录了基因在不同组织的芯片、RNAseq、蛋白表达信息,甚至是不同的血液细胞、肿瘤细胞系等的表达情况。
11基因的同源性信息,可以直接查看基因间的序列相似性。
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